中国孔子研究院是国务院1996年批准设立的研究孔子及其思想的专门机构，具有学术研究与交流、博物展览、文献收藏、孔子及儒学研究信息交流、人才培训等功能，规划建设成为世界儒学研究与交流中心。
孔子研究院工程由中国科学院院士、工程院院士、
清华大学教授吴良镛先生规划设计。总体布局构图以方和圆作为基本母题，用隐喻方式充分表达中国文化内涵，将儒学的“仁”、“和”观念融入规划之中，借鉴“洛书”、“河图”、“九宫”格式及风水学说理论，将现有地段匠心独运、合理布局。建筑形式充分表达了孔子的文化思想内涵，体现了民族性、时代性和纪念性。
杏坛
院门两侧，杏花摇曳，仔细一数，每侧恰为36株，孔子杏坛设教，弟子三千，贤人七十有二，不用说，杏树是象征七十二贤的。穿过大门，脚下是用红色的花岗岩或横或竖铺成的甬路，一行圆形的汉白玉镶嵌在甬路正中，仔细一看，原来是古代玉佩的图案。孔子是古代文化的热心继承倡导者，极力推崇周代礼乐文化，礼乐也成为孔子思想的一个重要组成部分。设计者研精覃思，在如此平常的通道上也刻划了如此厚重的传统文化符号。
东西两坊
跨过石桥，迎面两坊相射而立，东坊题“志道据德”，西坊题“依仁游艺”。典故出自《论语》，“子曰‘志于道，据于德，依于仁，游于艺’”，孔子以此教人，我们也应依此做人。
牌坊
牌坊是中心广场的入口，过坊就是辟雍广场。广场呈方形，80米见方，北面主楼俯视，东、西、南三面长廊围护。
高台明堂
广场正北是高30米的主楼。楼88.8米见方，是传统的高台明堂式建筑。高四层，一层为台基，内设图书室、阅览室。二层方形，三、四层圆形，寓意天圆地方。脊吻为凤，凤是祥鸟，只有天下清平有道时才会出现，所以在春秋礼崩乐坏的时期，孔子认为天下有道无望，发出“凤鸟不至，河不出图，吾已矣夫”的悲叹。如今天下清平，凤凰来仪，孔子有知，当会欣然而笑。
主厅
二、三层主厅现举办着孔子纪念展览，以图片、器物、雕塑、绘画等形象地介绍孔子的生平、孔子的思想、儒学的发展和孔子思想在海内外的影响，仔细参观，如同浏览一部孔子思想简史。
二层主厅后面还有两个展厅，西厅“千年香烟”主要展出历代祭祀孔子的祭祀文物，而东厅展出当代著名书画家书画作品和海外政治闻人对孔子的评价题词，由此可见古今中外对孔子的敬仰。
乘电梯直上四楼，圆形的展橱内陈列着金版《四书》——中文的《大学》、《中庸》、《论语》、《孟子》和英文《论语》，书铜版鎏金，美轮美奂，恐怕是世界上第一部金属版《四书》。
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